1830年、ワイマールに滞在中、メンデルスゾーンはゲーテのもとを訪れ、そこで演奏したうちの一曲が、この《幻想曲 嬰ヘ短調「スコットランド・ソナタ」》であったとされている。メンデルスゾーンは1828年に《スコットランド・ソナタ》という曲の作曲をはじめ、その後、５年間、これを書きなおし続けた。そして、1834年に出版したものが、この《幻想曲 嬰ヘ短調「スコットランド・ソナタ」》である。

全３楽章からなり、全曲通して演奏される。

第１楽章：嬰へ短調 ４分の２拍子 コン・モート・アジタート―アンダンテ

冒頭８小節にわたるアルぺッジョの序奏（コン・モート・アジタート）からはじまる。アンダンテの主部につづき、登場するアルぺッジョの挿句は、徐々に勢いと音量を増し、クライマックスを形成する。大きな変化が加えられた再現部が奏されたのち、序奏のアルペジオが再び現れ、幻想的に曲をとじる。

第２楽章：イ長調 ２分の２拍子 アレグロ・コン・モート

およそＡ－Ｂ－Ａの形によっており、スケルツォ的な性格をもつ。対位法的な技法が用いられた短い楽章。

第３楽章：嬰へ短調 ８分の６拍子 プレスト

即興的な性格が強いが、およそソナタ形式によっている。第一主題は、６連音符の下降音形からなり、めまぐるしく動く。第２主題は、オクターブでゆったりとうたわれる。６連音符は、一曲全体を貫いており、その音形の変化によってさまざまな表情がうみだされている。情熱的な終曲。